R, C++ and Rcpp

###Rcpp

1. 为什么使用Rcpp

R作为解释性的语言，缺点就是运行速度慢，特别是在有loop的时候。而编译性的语言在这方面有着自身的优势（先全部编译，然后链接，装载，以后就不用解释了，速度就相对较快）

2. Rcpp的两种植入方式

1）.先编写一个cpp文件，然后再R语句中调用这个cpp文件中的函数

这里的cpp文件我们还是使用前面说过的mysweep方法来举例子，转mysweep ，需要注意的是，这里格式中一定要有// [[Rcpp::export]]，感觉像是注释没有用，但是少了这句文件就运行不起来。

然后在R语言中如何引用这个函数呢？只需在R文件头加上 library(Rcpp) 和一句调用的语句 sourceCpp(mySweep_cpp.cpp)，之后就可以在R中使用cpp函数mysweep_cpp 。关于从cpp到R的过程中数据类型的过度，这里有NumericMatrix，NumericVector等一些类型。很好实现两种语言的对接。

下面是纯R写的sweep函数

比较两中编写方式的速度：

得到的结果为：

可见使用Rcpp能很明显提高loop的速度！

2）. 不写cpp文件，直接在R语言中加入cpp语句

和上面的区别不大，但是就是只能在一个cppFunction中定义一个cppfunction。